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花生a基因组测序工作会议在深圳召开

11月27日上午,花生 a基因组测序协助组在深圳千年盛世基因科技公司会议室召开。山东圣丰种业科技有限公司科研总监李洪杰、山东省花生研究所禹山林研究员、广东农业科学院作物研究所梁炫强博士和陈小平博士、国际半干旱植物研究所rajeev 博士以及macrogen公司中国区总裁于悦、changhoon kim 博士、jong-so kim博士和hwanseok rhee 博士参加了会谈。会谈中rajeev博士对当前国际上花生基因组研究最新进展做了分析,并指出了花生 a基因组测序任务的紧迫性和应对策略,最后预期基因组测序后的工作方向。
国际花生基因组研究进展方面,美国a基因组测序尚未启动,b 基因组和四倍体栽培种基因组已经启动。图谱方面,已经完成了 a基因和b 基因组的物理图谱。在此不利局势下,a基因组测序项目各方负责人要求加快测序进程,同时要求测序和数据分析同步进行。macrogen公司方该项目主要负责人表示给予配合,并已表态于2013年1月份完成基因组的 wgs测序工作。 
花生a基因组测序完成之后,在面对下一步的工作方向该如何制订这个问题上,rajeev博士建议中国方面尽量避开 b 基因组和四倍体基因组的测序工作,针对中国
现有的育种家品种及地方品种进行重测序,结合性状调查的结果进行全基因组关联分析,以最大限度最快速度将测序的结果应用于育种的实际工作中去a基因组测序项目各方主要负责人在这方面已达成了初步的共识,赞同 rajeev博士的提议,并希望各方能够进一步更深入的合作。 
在会谈的最后macrogen 公司代表介绍了项目当前的进展情况。目前high-seq 测序已经完成,而 454测序正在进行过程中。high-seq 的测序结果显示:a基因组大小为1.38g,接近于预期的 1.4g;测序数据的覆盖度为 52x;基因组的重复序列比例为 70%,而其他物种一般在50%左右,这说明花生 a基因组的复杂程度非常高。